有区别。神曲是 经发酵而成的加工品，为全麦粉和其它（青蒿、苍耳、辣蓼、杏仁、赤小豆等）混合后经发酵而成的加工品。
焦神曲：取神口是置锅内炒至外表呈焦黑色。
麸神曲：取麸皮撒匀于热锅内，在将神曲倒入，炒至黄色。区别：焦神曲没加麸皮，麸神曲加了麸皮。
大黄具有清热通肠、凉血解毒、祛瘀通经的作用。焦糖麦芽对淀粉类食品有较好的消化作用；焦糖山楂对因肉多或油腻引起的食物迟缓有较好的治疗作用；焦神曲对米粉类食品有较好的消化作用。三药合用能明显增强消化功能。消肿、肠痈、腹痛、痈、血瘀、闭经、跌伤，外用治疗水火烧伤；上消化道出血可明显增强消化功能。
放入口中尝，微苦微涩，酸的神曲则为优质，没有以上性味的择为劣质
三仙焦在中医处方上是三味药，即焦麦芽，焦山楂，焦神曲。
焦神曲就是：取神曲置锅内炒至外表呈焦黑色，内部焦黄色，取出，略喷些清水，放凉。神曲为辣蓼、青蒿、杏仁泥、赤小豆、鲜苍耳草加入面粉发酵而成的曲剂。长方形块状，宽约3厘米，厚约1厘米，外表土黄色，有陈腐气，味苦。焦神曲与神曲攻效作用不同。
焦山楂，焦麦芽，焦神曲每样各20克就可以。
焦三仙在中医的处方上是“一味”药。但它不是一味药而是三味药，即焦麦芽、焦山楂、焦神曲。经常合用有良好的消积化滞作用。
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