灵芝菌丝体为白色绒毛状，由成千上万条菌丝互相结合所构成的。菌丝体再互相结合便形成各种菌丝组织。灵芝的菌丝体是其营养体。在自然条件下，它侵入到腐木、朽木等适于其生长的基质中；在人工培养条件下，则生长在培养基或培养料中。在基物的表面，菌丝体会形成白色、绒毛状菌丝层，它是由菌丝体的气生菌丝及分泌物共同组成的一种营养结构。菌丝体一般发育顺序为：初生菌丝体、二次菌丝体和三次菌丝体。

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