在甲基转移酶的催化下，dna的cg两个核苷酸的胞嘧啶被选择性地添加甲基，形成5－甲基胞嘧啶，这常见于基因的5-cg-3序列。大多数脊椎动物基因组dna都有少量的甲基化胞嘧啶，主要集中在基因5端的非编码区，并成簇存在。甲基化位点可随dna的复制而遗传，因为dna复制后，甲基化酶可将新合成的未甲基化的位点进行甲基化。dna的甲基化可引起基因的失活。
dna甲基化主要形成5－甲基胞嘧啶（5-mc）和少量的n6-甲基嘌呤（n6-ma）及7－甲基鸟嘌呤（7-mg）
dna甲基化是最早发现的修饰途径之一，大量研究表明，dna甲基化能引起染色质结构、dna构象、dna稳定性及dna与蛋白质相互作用方式的改变，从而控制基因表达。
常用的有硫酸二甲酯，碘甲烷等。一般都是在酸性或者路易斯酸的作用下甲基化。
亚硫酸氢根的钠盐可使未甲基化的胞嘧啶磺化和水解脱氨产生一种尿嘧啶磺酸盐中间产物然后DNA在另一种盐﹙试剂二﹚存在的条件下与一种微粒载体发生甲基化。
DNA甲基化methyltransferase, 缩写DNMT。它是表观遗传学领域研究的重点之一。DNA甲基化是指在DNA甲基转移酶的作用下，基因组DNA序列上CpG岛的二核苷酸5′端胞嘧啶转变为5′甲基胞嘧啶（5′ methylcytosine, 缩写5mC）。这种DNA修饰的方式并未改变基因的序列, 但能抑制某些基因的表达。
A指的是腺嘌呤、T指的是胸腺嘧啶、C指的是胞嘧啶、G指的是鸟嘌呤；生命体的遗传密码就是由ATCG来记录和传递的，如同一本神秘的生命密码本，指导着蛋白质的合成和功能调控，包括我们人类的生老病死、高矮胖瘦，甚至我们的性格和健康状况，基因都在默默的指导着，并且和环境因素、行为因素共同决定着我们的健康水平。
碱基共有8种：鸟嘌呤（G）、腺嘌呤（A）、胸腺嘧啶（T，DNA专有）、尿嘧啶（U，RNA专有）、5-胞嘧啶甲基、5-羟甲基胞嘧啶（5-hmC）、5-胞嘧啶甲酰（5-formylcytosine）、5-胞嘧啶羧基（5-carboxylcytosine）。
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