服用这些药物有可能会产生胃肠道的刺激，造成胃痛胃酸，或者是腹泻等现象，另外也有可能会引起药物的过敏现象，比如身体皮肤粘膜有皮疹，红肿，瘙痒，如果一旦出现不良反应的话，应该及时停止用药，尽早去医院复查，更换其他治疗措施，治疗身体的疾病。
治疗幽门螺旋杆菌一般采用四联疗法，也就是用4种药物进行治疗。这4种药物有不同的服用时间和方法，有的需要空腹的时候使用，有的需要饭后服用，主要看药物对胃黏膜有没有刺激性，保护胃黏膜的药物要在饭前服用，而抗菌消炎药物可以饭后服用。
幽门螺旋杆菌药物吃后可能是该药副作用导致会咳嗽疼。建议病人应该遵照医嘱按规律用药，不要自己将药物停掉或者是减量等，避免由于口服药物不及时或者错误的机遇，惹起幽门螺旋杆菌没有铲除。
由于治疗幽门螺杆菌的药物大多是消炎药，所以服用后会有一定的副作用，所以出现头晕，胃不舒服也属于正常的。建议可以按疗程按规律服用，要没有其他大的方面的问题可以不用停药，平时注意饮食营养真实搭配，亲要期间禁止辛辣刺激油炸食物，禁烟酒。
对于幽门螺旋杆菌的治疗，一般是建议选择一些西药制剂的抗生素类药物进行治疗，使用中成药的效果可能并不会很理想。幽门螺旋杆菌的存在，也有可能容易引起胃炎或者是消化性溃疡等疾病，如果患者已经出现了慢性胃病，建议可以在西药治疗的同时配合中医调理。
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