婴儿感冒灌肠的危害一个是由于力度过大，可能会引起肠粘膜损害，出现出血、疼痛等现象。另一个灌注的药物损害肠壁，引起黏膜性炎症。但是这两种情况很少见，可以控制。相对于灌肠的治疗效果来讲，完全可以忽略不计的。
如果小儿出现反复发烧的话，不能经常给宝宝进行灌肠。这是因为灌肠的药物中有的采用了激素，孩子比较小的时候容易发生中毒现象。
因此如果是比较小的宝宝的话，出现发烧的情况可以使用退烧药或者是从肛门塞入退烧栓以及采用物理降温的方法给宝宝退烧。
婴儿灌肠是直肠给药，有许多副作用。首先它影响婴儿的胃肠功能，导致消化不良、食欲不振、腹痛和腹泻，然后腹胀和呕吐。其次是直肠药物剂量大、刺激性强，可直接导致肠粘膜出血和便血。粘膜损伤长期无法治愈，可导致肠溃疡、营养液流失、婴儿营养不良，影响生长发育。
小孩灌肠一般是不建议的，反复灌肠可引起局部、肠道感染，灌肠属于侵入性操作，且孩子肠道黏膜娇嫩，长期灌肠有可能导致孩子肠道黏膜损伤，反复多次灌肠对宝宝的肛门、直肠有损伤，容易引起出血。尽量不要采用灌肠治疗，可以选择口服等安全性更高的方式。
一般情况下是没有什么太大危害的，但是嗓子发炎是不建议进行灌肠的，目前是可以服用一些消炎药物进行治疗，喉咙发炎主要考虑是因为扁桃体发有所引起，可以服用一些阿莫西林进行治疗，在通过药物治疗之后嗓子疼痛的症状也会得到缓解，在治疗期间也要多喝水。
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