跑在前面的蓝色条带是溴酚蓝，位置大约相当于300bp的DNA，后面的绿色条带是二甲苯青FF，相当于4000bp左右大小DNA的位置。
迁移率与胶琼脂糖的浓度是有关系的,还与DNA的性质（单链还是双链）有关。
在0.7%、1%、1.4%、2%的琼脂糖凝胶电泳中,溴酚蓝的迁移率分别与1000bp、600bp、200bp、150bp的双链线性DNA片段大致相同。
上样缓冲液中甘油与溴酚蓝的左右分别是① 上样缓冲液中包括甘油,溴酚蓝,SDS等,甘油主要作用是防止样品漂浮出点样孔,溴酚蓝作为电泳指示剂,用来观察电泳进度,SDS用于一些核酸结合蛋白的变性解离.②核酸染料与凝胶中核酸结合,以便于在紫外光下显示核酸条带.
溴酚蓝用于指示电泳终点，因为它跑在蛋白前面，一般当溴酚蓝跑到末端时停止电泳。
甘油比重大，使样品下沉，在点样孔底部铺成一线，避免样品漂逸，且带型锐利好看。溴酚蓝是指示剂，可以用来观察大概的电泳过程，因为它在不同浓度的胶中泳动的速率不一样，从而也可以看做是一个蛋白样品，这样就可以直观的大概了解蛋白泳动到了哪个位置，但是只能看一个大概，还需要蛋白质Marker，才能更准确的观察你的目的蛋白跑到了什么位置
是一种pH指示剂，在pH 3.0~4.6范围，颜色由黄变蓝。常用做电泳指示染料，凝胶中电泳迁移速度在小分子核酸或蛋白质区域。 从乙酸及丙酮混合液中析出者为长六角形棱柱状结晶。近似黄色或浅玫瑰色结晶性粉末，微溶于水及乙醚，溶于乙醇或稀碱液及氨液中呈蓝色。PH变色范围 3.0(黄)~4.6(蓝紫)
【溶解情况】 微溶于水，易溶于甲醇、乙醇和苯，可自由溶于氢氧化钠溶液，同时形成溴酚蓝钠盐水溶液。
【用途】 pH指示剂，pH=3.0时呈黄色，pH=4.6时呈蓝紫色。酸碱指示剂；非水滴定用指示剂，蛋白电泳染色；病毒化验等。
【制备或来源】 将苯酚磺酰酞悬浮于醋酸中，然后徐徐加入溴，并使溴过量，在搅拌下，于50℃进行反应而得。
【其他】 溴酚蓝分解温度279℃，在210℃绿色升华物退色为橙色。
溴酚蓝呈蓝色，而蛋白质是白色，在SDS-凝胶中不明显，再次，溴酚蓝的相对分子量比蛋白质(绝大部分)小，电泳时速度比蛋白质稍快，因此可用作指示，当溴酚蓝到达电泳槽底部(可看蓝色调带)，则电泳结束。
若无溴酚蓝，不好蛋白质电泳到槽底的时间。如果所有的蛋白质都电泳到了底部，还有意义吗?就没有区别出其移动速度(对应于相对分子质量)。相关推荐：