DNA聚合酶I的二级结构以螺旋为主，可划分为A至R共18个螺旋肽段。螺旋肽段之间由非螺旋结构连接。其中H区与I区之间的无规则结构较长，有50个氨基酸残基，I螺旋与O螺旋之间由较大的空隙，可以容纳DNA链，而50个氨基酸的无规结构，就像一个盖子那样与I、O螺旋区共同把DNA链包围起来，使其向一个方向滑动。DNA聚合酶I只能催化延长约20个核苷酸左右，说明它不是复制延长过程中起作用的酶。
原核生物启动子中 RNA 聚合酶牢固结合并打开 DNA 双链的部分称为 Pribnow box，RNA聚合酶全酶形式为α2ββ’δ,共5个亚基. α亚基与RNA聚合酶的四聚体核心（α2ββ’）的形成有关； β亚基含有核苷三磷酸的结合位点； β’亚基含有与DNA模板的结合位点。
DNA聚合酶主要成分是蛋白质，功能是使DNA复制链与母链结合为双螺旋结构。
因为DNA是规则的双螺旋结构，试想复制肯定时要得到跟原来一模一样的两个DNA分子，并且该种酶的本质是蛋白质从而具有专一性,所以DNA聚合酶只能催化从5到3的DNA复制方向 根据这一点 你观察磷酸连接的碳原子的位置就可得出结论
原核DNA聚合酶III由多个亚基组成，是原核生物大肠杆菌染色体DNA复制的主要酶。该酶由核心酶和全酶两种形式，全酶由核心酶，滑动嵌和嵌载复合物组成，复制起始的时候需要滑动嵌锚地DNA并驱动酶的前进。
这种特殊的结构可以大大增加增加DNA复制的进行性。此酶具有5‘-3’的聚合酶活性和3‘-5’的外切酶活性。
四种活性:
（1）5′→3′DNA聚合酶活性：反应底物为单链DNA及引物（带3′-OH基）或5′突出的双链DNA。
（2）5′→3′外切核酸酶活性：反应底物是双链DNA或DNA∶RNA杂交体，它可从5′端降解双链DNA，也降解RNA∶DNA中的RNA（RNase：H活性）。
（3）3′→5′外切酶活性：反应底物是带3′-OH的双链DNA或单链DNA，其活性从3′-OH端降解DNA，可被5′→3′聚合活性封闭，也可被带5′磷酸的dNMP所抑制。
（4）交换（置换）反应：如果只有一种dNTP存在，3′→5′外切活性将从3′-OH端降解DNA，然后在该位置发生一系列连续的合成和外切反应，直到露出与该dNTP互补的碱基。
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