真核生物RNA聚合酶分子大于5×105，由10～12个大小不等亚基组成。
原核生物RNA聚合酶
研究得最清楚的是大肠杆菌RNA聚合酶。该酶是由五种亚基组成的六聚体（α2ββωσ）分子量约500 000。其中α2ββω称为核心酶，σ因子与核心酶结合后称为全酶。
相同点：都能以DNA为模板，从5'向3'进行核苷酸或脱氧核苷酸的聚合反应。不同点：
1、作用底物不同。RNA聚合酶底物是NTP；DNA聚合酶底物是dNTP。
2、RNA聚合酶作用不需要引物，而DNA聚合酶作用需要引物。
3、RNA聚合酶本身具有一定的解旋功能，而DNA聚合酶没有，当需要解开双链的时候要解旋酶和拓扑异构酶的帮助。
4、RNA聚合酶只具有5‘到3’端的聚合酶活性，而DNA聚合酶不仅有5‘到3’端的聚合酶活性，还具有3‘到5’端的外切酶活性。保证DNA复制时候校对，所以复制的忠实性高于转录的。5、RNA聚合酶通常作用于转录过程；DNA聚合酶通常作用于DNA复制过程。
DNA分子复制需要模板、原料、能量和酶等基本条件。在细胞内，DNA能组织成染色体结构，整组染色体则统称为基因组。
染色体在细胞分裂之前会先行复制，此过程称为DNA复制。对真核生物，如动物、植物及真菌而言，染色体是存放于细胞核内；对于原核生物而言，如细菌，则是存放在细胞质中的拟核里。
染色体上的染色质蛋白，如组蛋白，能够将DNA组织并压缩，以帮助DNA与其他蛋白质进行交用，进而调节基因的转录。
DNA携带有合成RNA和蛋白质所必需的遗传信息，是生物体发育和正常运作必不可少的生物大分子。
rna聚合酶是以一条DNA链或RNA为模板，三磷酸核糖核苷为底物、通过磷酸二酯键而聚合的合成RNA的酶，因为在细胞内与基因DNA的遗传信息转录为RNA有关，所以也称转录酶。rna聚合酶作用于磷酸二酯键。
rna聚合酶需要四种核糖核苷酸三磷酸(NTP：ATP、GTP、CTP、UTP)作为RNA聚合酶的底物，DNA为模板，二价金属离子Mg2+、Mn2+是该酶的必需辅因子。其催化的反应表示为：(NMP)n+NTP→(NMP)n+1+PPi。RNA链的合成方向也是5’→3'，第一个核苷酸带有3个磷酸基。其后每加入一个核苷酸脱去一个焦磷酸，形成磷酸二酯键，焦磷酸迅速水解的能量驱动聚合反应。与DNA聚合酶不同，RNA聚合酶无须引物，它能直接在模板上合成RNA链;RNA聚合酶能够局部解开DNA的两条链，所以转录时无须将DNA双链完全解开，RNA聚合酶无校对功能。
RNA聚合酶催化RNA的合成，其与DNA聚合酶有许多相同的催化特点：①以DNA为模板;②催化核苷酸通过聚合反应合成核酸;③聚合反应是核苷酸形成3’，5’一磷酸二酯键的反应;④以3’→5’方向阅读模板，5’→3’方向合成核酸;⑤按照碱基配对原则忠实转录模板序列。
RNA解旋酶，DNA连接酶，DNA解旋酶与氢键有关。
DNA聚合酶与3-5磷酸二酯键有关
RNA聚合酶（RNA polymerase）:以一条DNA链或RNA为模板催化由核苷-5′-三磷酸合成RNA的酶。是催化以DNA为模板（template）、三磷酸核糖核苷为底物、通过磷酸二酯键而聚合的合成RNA的酶。因为在细胞内与基因DNA的遗传信息转录为RNA有关，所以也称转录酶
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