1、性质不同 协同效应为一种化学现象，又称增效作用，指两种或两种以上的组分相加或调配在一起，所产生的作用大于各种组分单独应用时作用的总和。 别构效应又称为变构效应，是寡聚蛋白与配基结合改变蛋白质的构象，导致蛋白质生物活性改变的现象。
2、应用不同 协同效应常用于指导化工产品各组分组合，以求得最终产品性能增强。 别构效应在生命活动调节中起很重要作用。如阻遏蛋白受小分子物质的影响发生构象变化，改变了它与DNA结合的牢固程度，从而对遗传信息的表达进行调控。另如激素受体，神经递质受体等都是通过生物分子的影响发生构象变化而传递信息的。可以说别构效应是生物分子“通讯”地基。
3、产生原因不同 普遍认为催化协同效应的产生是源自混杂多于一种活性金属；或是给质子位置的产生；或者是纳米颗粒上表面形貌的改变造成的电子结构的改变。 别构效应可分为同促效应和异促效应两类。相同配体（相同的结合部位）引起的反应称为同促效应，例如寡聚体酶或蛋白质（如血红蛋白）各亚基之间的协同作用即是同促效应。同促效应是同一种物质作用于不同亚基的相同部位而发生影响，因此是别构效应。 不同配体（不同的结合部位）引起的反应称为异促效应，例如别构酶的别构结合部位和底物结合部位之间的反应即是异促效应。 联系：协同效应和别构效应都引起组分的改变。 来源：-别构效应 来源：-协同效应
协同进化涉及到生物和生物之间还有生物和非生物之间得相互影响，所以协同进化比生物之间相互影响的范围大一些
协同作用：是依赖于某些元素的作用而加强另一元素的生物学功能, 或使该元素的有效水平增加。例如与造血有关的微量元素有铜、铁、钴、锰等多个元素, 它们分别作用于造血的不同环节, 相互配合, 共同完成造血功能。
拮抗作用：是指在动物消化道中，元素之间互相抑制其吸收作用;对各自在动物体内的生理生化功能，互相产生相反的影响。拮抗作用多表现为单方面的，但也可以是双方面的。
两个相互作用的物种在进化过程中发展的相互适应的共同进化。
一个物种由于另一物种影响而发生遗传进化的进化类型。
协同进化是生物与环境的交互关系，是一种协同关系，古生物学的物种是形态种，在一定程序上与交配群的概念是一致的。
物种又是生态单位。隔离成种的理论与多地区成种并不矛盾。生态系与基因的协同作用表现在多方面，生态系的变动会影响基因，生物的相互作用也影响基因。
你好像类似猫和鼠的关系是捕食与被捕食的关系，他们不能称为敌对。
非洲草原上狮子，野狗，猎豹之间算是敌对的，他们常争夺食物和地盘。
很多植食动物也会有敌对关系，例如一片丛林中食物相同的两类猴子。
相互合作的有鳄鱼和牙签鸟（没有可靠证据），犀牛和犀牛鸟，海葵和寄居蟹，鲨鱼和向导鱼等等。
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