顺反异构：立体异构的一种，由于双键不能自由旋转引起的，一般指烯烃的双键，也有C=N双键，N=N双键及环状等化合物的顺反异构。顺式异构体：两个相同原子或基团在双键同一侧的为顺式异构体，也用 cis- 来表示。反式异构体：两个相同原子或基团分别在双键两侧的为反式异构体，也用 trans- 来表示。顺反异构体产生的条件：⑴ 分子不能自由旋转（否则将变成另外一种分子）；⑵ 双键上同一碳上不能有相同的基团；。
所谓＂顺反＂是指碳碳双键的两侧是否连接相同基团。这是判断顺反中的类型；
接不同的基团是就双键上的碳原子而言的。这是判断是否构成顺反。
顺式反式区别主要看DNA。
顺式：cis-acting，同一染色体上的DNA序列直接调控其他邻近基因的表达。即DNA对DNA。
顺式反式区别主要看DNA
顺式：cis-acting，同一染色体上的DNA序列直接调控其他邻近基因的表达。即DNA对DNA。
反式：trans-acting，DNA通过其产物（mRNA或蛋白质）间接调节基因的表达。用以描述基因元件的专有名词，如阻遏物基因与转录因子基因，它们可以影响位于不同染色体上的其他基因。这些反式作用基因通过产生能远距离作用的可扩散物质发挥功能。即DNA----Pr----DNA。
顺式作用元件指的是在同一条核苷酸链上起调控基因作用的核酸序列，常不编码蛋白质合成。
反式作用因子则对不同核酸链上的基因表达起到调控作用的蛋白，编码该蛋白的基因与其识别结合作用的核酸链不是同一链。多细胞有机体在生长、分化和发育过程中需要整合不同组织的、发育的、环境的信号调节基因表达，转录起始的调节是其中的重要一环。
顺式作用（cisacting）元件同一DNA分子中具有转录调节功能的特异DNA序列，即具有特殊功能的转录因子DNA结合位点和其他调控基序（motif）。
顺式作用元件：真核生物中没有操纵子，调节基因中调控序列有许多能结合调控蛋白的元件叫顺式作用元件，它们往往与结构基因保持一定的距离。
反式作用因子：指和顺式作用元件结合的可扩散性蛋白，包括基础因子，上游因子，诱导因子。
真核生物的转录调控是调控的最重要的途经，大多是通过顺式作用元件和反式作用因子复杂的相互作用而实现的。顺式作用元件(cis-actingelement)存在于基因旁侧序列中能影响基因。
上游因子是反式作用因子。反式作用因子是转录模板上游基因编码的一类蛋白调节因子，包括激活因子和阻遏因子等，它们与顺式作用元件中的上游激活序列特异性结合，对真核生物基因的转录分别起促进和阻遏作用。
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