1.原理不同：抗原在进入机体后，可诱发机体出现免疫反应，进而产生了抗体。抗体则是在抗原的刺激下，体内的B淋巴细胞分化成了浆细胞，进而产生的一种免疫球蛋白，可以与相应的抗原结合。
2.作用不同：抗原对机体来说是一种外来物质，能起到诱发机体产生抗体的作用。抗体是机体本身产生的物质，能够有效的除掉入侵体内的病原体，通常对机体有保护作用。
抗原反应又称为抗原抗体反应，是指抗原与相应抗体之间所发生的特异性结合反应。这种反应既可在机体内进行，也可以在机体外进行。抗原抗体反应的过程是经过一系列的化学和物理变化，包括抗原抗体特异性结合和非特异性促凝聚两个阶段，以及由亲水胶体转为疏水胶体的变化。
DNA分子杂交是利用DNA分子探针与样品中的DNA分子进行杂交； 抗原-抗体杂交是利用已经制备好的抗原与表达出的的蛋白质进行结合，这里的蛋白质相当于抗原，人们进行检测量用到的物质相当于抗体。
抗原和抗体是有着非常大的区别的，抗原是指能引起抗体生成的物质，而抗体是指机体由于抗原的刺激而产生的具有保护作用的蛋白质。而抗体是由抗原刺激机体产生的，能与抗原特异性结合是抗原失去毒性的球蛋白。简单来说，抗原是外来物质，而抗体是人体的浆细胞分泌的用来对抗抗原的物质。抗原是进攻我们身体的“坏蛋”，而抗体则是保卫身体健康的“勇士”。
吞噬细胞能清除抗原主要是依靠溶酶体内的酶。解析：
1.溶酶体内含有多种水解酶，能吞噬并杀死侵入细胞的病毒或病菌。溶酶体释放水解酶处理抗原，将抗原逐渐消化。
2.大多数病毒进入人体内经过吞噬细胞的摄取和处理，使抗原决定簇暴露于抗原的表面，并将抗原呈递给T细胞，刺激T细胞分泌淋巴因子。
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